MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011981	AGC	2	6	322648	322653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102675
5502	NC_011981	TCA	2	6	322766	322771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102675
5503	NC_011981	GCG	2	6	322956	322961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102675
5504	NC_011981	GCA	2	6	322982	322987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102675
5505	NC_011981	TCC	2	6	323002	323007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102675
5506	NC_011981	GAC	2	6	323058	323063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102675
5507	NC_011981	CCA	2	6	323109	323114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102675
5508	NC_011981	GAT	2	6	323124	323129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102675
5509	NC_011981	CTT	2	6	323186	323191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102675
5510	NC_011981	CGG	2	6	323288	323293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102676
5511	NC_011981	ACG	2	6	323365	323370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102676
5512	NC_011981	ATG	2	6	323497	323502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102676
5513	NC_011981	CGA	2	6	323579	323584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102676
5514	NC_011981	TCC	2	6	323590	323595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102676
5515	NC_011981	TCG	2	6	323606	323611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102676
5516	NC_011981	GCA	2	6	323615	323620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102676
5517	NC_011981	GCG	2	6	323630	323635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102676
5518	NC_011981	GCG	2	6	323687	323692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102676
5519	NC_011981	CTG	2	6	323700	323705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102676
5520	NC_011981	GC	3	6	323821	323826	0 %	0 %	50 %	50 %	222102676
5521	NC_011981	TCG	2	6	323866	323871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102676
5522	NC_011981	AGA	2	6	323962	323967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102676
5523	NC_011981	CG	3	6	324020	324025	0 %	0 %	50 %	50 %	222102676
5524	NC_011981	TCAT	2	8	324136	324143	25 %	50 %	0 %	25 %	222102676
5525	NC_011981	CCG	2	6	324169	324174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102676
5526	NC_011981	GTG	2	6	324208	324213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102676
5527	NC_011981	CGA	2	6	324236	324241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102676
5528	NC_011981	ATG	2	6	324244	324249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102676
5529	NC_011981	CAC	2	6	324285	324290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102676
5530	NC_011981	TTG	2	6	324310	324315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102676
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5532	NC_011981	TAG	2	6	324408	324413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102677
5533	NC_011981	CGC	2	6	324445	324450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102677
5534	NC_011981	TGTGT	2	10	324455	324464	0 %	60 %	40 %	0 %	222102677
5535	NC_011981	TTC	2	6	324471	324476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102677
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5539	NC_011981	CGA	2	6	324631	324636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102677
5540	NC_011981	CG	3	6	324655	324660	0 %	0 %	50 %	50 %	222102677
5541	NC_011981	CAG	2	6	324737	324742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102677
5542	NC_011981	TCC	2	6	324924	324929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102677
5543	NC_011981	GTG	2	6	324948	324953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102677
5544	NC_011981	AGC	2	6	325017	325022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102677
5545	NC_011981	GAT	2	6	325043	325048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102677
5546	NC_011981	CGG	2	6	325132	325137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102677
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5550	NC_011981	AGG	2	6	325195	325200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102677
5551	NC_011981	CGATG	2	10	325249	325258	20 %	20 %	40 %	20 %	222102677
5552	NC_011981	CGC	2	6	325306	325311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102677
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5555	NC_011981	CGA	2	6	325616	325621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102678
5556	NC_011981	CGC	2	6	325626	325631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102678
5557	NC_011981	CGG	2	6	325649	325654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102678
5558	NC_011981	ATC	2	6	325720	325725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102678
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5560	NC_011981	GGC	2	6	325848	325853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102678
5561	NC_011981	GTT	2	6	325950	325955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102678
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5601	NC_011981	CT	3	6	328334	328339	0 %	50 %	0 %	50 %	222102680
5602	NC_011981	GGCA	2	8	328400	328407	25 %	0 %	50 %	25 %	222102680
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5615	NC_011981	GGCGG	2	10	329178	329187	0 %	0 %	80 %	20 %	222102680
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5741	NC_011981	CTG	2	6	336990	336995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102688
5742	NC_011981	TTC	2	6	337006	337011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102688
5743	NC_011981	GCT	2	6	337017	337022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102688
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5830	NC_011981	GGCT	2	8	341477	341484	0 %	25 %	50 %	25 %	222102693
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5854	NC_011981	TCGG	2	8	342716	342723	0 %	25 %	50 %	25 %	222102694
5855	NC_011981	GCC	2	6	342740	342745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102694
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5858	NC_011981	TTA	2	6	342831	342836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102694
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5982	NC_011981	GCA	2	6	350910	350915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102701
5983	NC_011981	CCA	3	9	350946	350954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102701
5984	NC_011981	GC	3	6	350963	350968	0 %	0 %	50 %	50 %	222102701
5985	NC_011981	ACC	2	6	351023	351028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102701
5986	NC_011981	CAG	2	6	351043	351048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102701
5987	NC_011981	GCA	2	6	351080	351085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102701
5988	NC_011981	GGC	2	6	351094	351099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102701
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5991	NC_011981	CG	3	6	351183	351188	0 %	0 %	50 %	50 %	222102702
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